Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
DUOX2Q9NRD8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DUOX2Q9NRD8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms