Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM8Q9NQV8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM8Q9NQV8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms