Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRTAC1Q9NQ79 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRTAC1Q9NQ79 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms