Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMMDC1Q9NPL8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TIMMDC1Q9NPL8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms