Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IL1RAPQ9NPH3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms