Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms