Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPCPD1Q9NPB8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPCPD1Q9NPB8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPCPD1Q9NPB8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPCPD1Q9NPB8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPCPD1Q9NPB8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPCPD1Q9NPB8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPCPD1Q9NPB8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPCPD1Q9NPB8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPCPD1Q9NPB8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPCPD1Q9NPB8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms