Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CABP2Q9NPB3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CABP2Q9NPB3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CABP2Q9NPB3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CABP2Q9NPB3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms