Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB6Q9NP58 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB6Q9NP58 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms