Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms