Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX8Q9HC52 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX8Q9HC52 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms