Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LY9Q9HBG7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LY9Q9HBG7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms