Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
CLSPNQ9HAW4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLSPNQ9HAW4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms