Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRKRIP1Q9H875 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms