Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1DQ9H5J8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1DQ9H5J8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms