Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRDM12Q9H4Q4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM12Q9H4Q4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms