Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC113Q9H0I3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms