Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP44Q9H0E7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
USP44Q9H0E7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms