Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms