Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms