Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LNPKQ9C0E8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms