Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CIPCQ9C0C6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms