Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM6SF1Q9BZW5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
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