Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF17Q9BXT8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms