Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSBP4Q9BWG4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms