Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC94Q9BW85 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms