Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF4Q9BUZ4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms