Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDC1Q9BTX1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDC1Q9BTX1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms