Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms