Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CITED1Q99966 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CITED1Q99966 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CITED1Q99966 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CITED1Q99966 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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