Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms