Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE1Q96RT6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE1Q96RT6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms