Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCNAQ96QF7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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