Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
NEUROD6Q96NK8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms