Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms