Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC138Q96M89 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms