Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C2orf48Q96LS8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf48Q96LS8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms