Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1Q96KN7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms