Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
LRRIQ1Q96JM4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms