Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFRP2Q96HF1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFRP2Q96HF1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms