Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms