Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms