Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms