Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPDL1Q96EA4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPDL1Q96EA4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms