Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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CCDC74AQ96AQ1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
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CCDC74AQ96AQ1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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CCDC74AQ96AQ1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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CCDC74AQ96AQ1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC74AQ96AQ1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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