Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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TRIM63Q969Q1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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TRIM63Q969Q1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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