Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A3Q93084 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms