Protein–RNA interactions for Protein: Q93052

LPP, Lipoma-preferred partner, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPPQ93052 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPPQ93052 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPPQ93052 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPPQ93052 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPPQ93052 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPPQ93052 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPPQ93052 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPPQ93052 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPPQ93052 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPPQ93052 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LPPQ93052 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPPQ93052 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPPQ93052 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPPQ93052 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPPQ93052 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPPQ93052 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPPQ93052 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPPQ93052 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPPQ93052 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPPQ93052 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPPQ93052 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPPQ93052 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPPQ93052 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPPQ93052 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPPQ93052 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPPQ93052 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPPQ93052 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPPQ93052 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPPQ93052 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPPQ93052 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPPQ93052 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPPQ93052 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPPQ93052 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPPQ93052 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPPQ93052 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPPQ93052 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPPQ93052 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPPQ93052 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPPQ93052 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPPQ93052 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPPQ93052 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPPQ93052 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPPQ93052 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPPQ93052 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPPQ93052 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPPQ93052 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPPQ93052 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPPQ93052 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPPQ93052 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPPQ93052 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPPQ93052 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPPQ93052 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPPQ93052 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms