Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNKSR2Q8WXI2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNKSR2Q8WXI2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNKSR2Q8WXI2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNKSR2Q8WXI2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms