Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LMO7Q8WWI1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms